Franco Bertoni si è laureato nel 1977 alla Facoltà di Architettura dell'Università degli Studi di Firenze. Negli anni universitari e fino alla fine degli anni Settanta ha tenuto seminari sull'architettura neoclassica e sull'architettura e le arti a Vienna nel XX secolo alla Facoltà di Architettura di Firenze. Ha affiancato alla libera professione una attività di ricerca storica e di critica i cui principali interessi sono: l'architettura neoclassica, l'arte e la ceramica del Novecento italiano ed europeo, il Minimalismo e l'architettura moderna.
Ha collaborato con gli editori: Touring Club d'Italia, Umberto Allemandi, Electa Mondadori, Birkhauser, Rizzoli New York, Daco Verlag, la Plume, Academy Editions, la Biblioteca, Octavo, Prestel e Mardaga.
Dal 1983 è docente di Metodologia della Progettazione all'Istituto Superiore Industrie Artistiche di Faenza.
Dal 2003 al 2010 è stato Curatore delle Collezioni Moderne e Contemporanee del Museo Internazionale delle Ceramiche in Faenza.
Dal 2011 è Direttore Artistico del Museo Civico Giuseppe Ugonia di Brisighella.
Tra le pubblicazioni, che ammontano a oltre duecento titoli, si citano: Philippe Starck. L'architettura del 1994, Robert Wilson del 1997; Claudio Silvestrin del 1999; Architettura minimalista del 2002; Design minimalista del 2004; Ceramica italiana del Novecento del 2005; Bertozzi e Casoni. Nulla è come appare. Forse del 2008; Enzo Cucchi/Ceramica e Bertozzi e Casoni. Opere/Works 1980-2010 del 2010; Sandro Chia, Ceramica vs Disegno 1:0 e Claudio Silvestrin del 2011, Gio Ponti. “Idee” d'arte e di architettura a Imola e in Romagna del 2012.
Per i suoi contributi sul Minimalismo è stato invitato al Guggenheim Museum di New York nel 2004, ha tenuto conferenze sull'arte e l'architettura del Novecento a Roma, Firenze, Ravenna, Savona, Bologna, Belgrado, Zagabria, Mendrisio ed è stato membro di giuria in vari concorsi italiani ed europei.